ഒരേ തന്മാത്രാ സൂത്രവാക്യം ഉള്ള സംയുക്തങ്ങൾ, എന്നാൽ ആറ്റങ്ങളുടെ അല്ലെങ്കിൽ ഗ്രൂപ്പുകളുടെ വ്യത്യസ്ത സ്പേഷ്യൽ ക്രമീകരണം സ്റ്റീരിയോ ഐസോമറുകളാണ്, ഈ പ്രതിഭാസത്തെ സ്റ്റീരിയോ ഐസോമെറിസം എന്ന് വിളിക്കുന്നു. ഇത് ഒപ്റ്റിക്കൽ ഐസോമെറിസം, ജ്യാമിതീയ ഐസോമെറിസം, കോൺഫോർമേഷൻസ് എന്നിങ്ങനെ മൂന്ന് തരത്തിലാണ്.
