"Had put" is the correct past perfect form for a hypothetical past condition (സാങ്കൽപ്പിക ഭൂതകാല അവസ്ഥയ്ക്കുള്ള). "Put" is simple past or present, "puts" is present tense third person singular, and "putting" is present participle.
If they had put more effort, they could have won the match. / കൂടുതൽ പരിശ്രമിച്ചിരുന്നെങ്കിൽ അവർക്ക് മത്സരം ജയിക്കാമായിരുന്നു.